Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms