Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ELLP55199 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELLP55199 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELLP55199 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELLP55199 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELLP55199 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELLP55199 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELLP55199 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELLP55199 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms