Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP12AP54707 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP12AP54707 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms