Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA1P49639 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms