Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNTAP49354 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTAP49354 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTAP49354 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTAP49354 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTAP49354 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNTAP49354 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTAP49354 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTAP49354 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTAP49354 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTAP49354 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNTAP49354 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNTAP49354 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNTAP49354 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms