Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SOX2P48431 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SOX2P48431 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SOX2P48431 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SOX2P48431 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SOX2P48431 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX2P48431 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms