Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GRIA1P42261 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIA1P42261 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIA1P42261 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms