Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYLC1P35663 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYLC1P35663 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms