Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NMBRP28336 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMBRP28336 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMBRP28336 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMBRP28336 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMBRP28336 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMBRP28336 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NMBRP28336 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMBRP28336 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMBRP28336 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMBRP28336 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMBRP28336 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMBRP28336 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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