Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms