Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KB1P23443 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms