Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXA5P20719 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms