Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SDSP20132 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SDSP20132 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDSP20132 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDSP20132 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDSP20132 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDSP20132 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SDSP20132 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDSP20132 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDSP20132 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDSP20132 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDSP20132 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDSP20132 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDSP20132 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms