Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN2P17655 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN2P17655 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms