Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA1P17302 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA1P17302 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA1P17302 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJA1P17302 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJA1P17302 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJA1P17302 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJA1P17302 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA1P17302 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA1P17302 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA1P17302 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms