Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EPB42P16452 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPB42P16452 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EPB42P16452 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPB42P16452 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPB42P16452 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPB42P16452 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPB42P16452 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms