Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARGP13631 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARGP13631 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARGP13631 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARGP13631 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RARGP13631 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RARGP13631 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARGP13631 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARGP13631 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RARGP13631 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RARGP13631 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms