Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LYL1P12980 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LYL1P12980 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LYL1P12980 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LYL1P12980 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LYL1P12980 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LYL1P12980 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms