Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSIG8P0DPA2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms