Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C4AP0C0L4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C4AP0C0L4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms