Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCA5LO95447 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5LO95447 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms