Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCATO75600 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GCATO75600 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GCATO75600 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCATO75600 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCATO75600 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCATO75600 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCATO75600 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCATO75600 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCATO75600 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms