Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT7O43581 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT7O43581 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYT7O43581 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYT7O43581 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYT7O43581 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYT7O43581 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms