Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATMINO43313 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATMINO43313 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATMINO43313 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATMINO43313 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATMINO43313 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATMINO43313 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATMINO43313 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATMINO43313 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATMINO43313 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms