Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSP2O14595 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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