Protein–RNA interactions for Protein: C9JVG2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JVG2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9JVG2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9JVG2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9JVG2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9JVG2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9JVG2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C9JVG2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9JVG2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9JVG2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C9JVG2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9JVG2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9JVG2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9JVG2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9JVG2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9JVG2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9JVG2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms