Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSBP1L1C9JCN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSBP1L1C9JCN9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms