Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HACD1B0YJ81 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HACD1B0YJ81 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms