Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCHNA4D1U4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms