Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC66A2RUB6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC66A2RUB6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms