Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms