Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms