Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PAXBP1Q9Y5B6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAXBP1Q9Y5B6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms