Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNND2Q9UQB3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms