Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMCC3Q9ULS5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMCC3Q9ULS5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms