Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms