Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTNAP2Q9UHC6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms