Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COX16Q9P0S2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX16Q9P0S2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms