Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBP1Q9NZI7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms