Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TOR4AQ9NXH8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TOR4AQ9NXH8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms