Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCF3Q9NUQ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms