Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms