Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPB41L5Q9HCM4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPB41L5Q9HCM4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms