Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCSER1Q9C0I3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCSER1Q9C0I3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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