Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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