Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC32Q9BV29 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms