Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NDUFAF3Q9BU61 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFAF3Q9BU61 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms