Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRDL1Q9BU40 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRDL1Q9BU40 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms