Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP3BQ9BS92 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms