Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDF4Q9BRK5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms